Насколько я помню, МАГИ были не только в японском отделе НЕРВ. В последних двух сериях канона атаку на эти МАГИ осуществляли другие  такие же системы из других отделов института. Так если Ангелы охотятся на МАГИ, зачем же они избрали именно эти своей целью, по сути, самые защищенные?

а кто сказал, что Ангелы охотятся на Маги? АНГЕЛЫ больше всего напоминают сложные биокомпьютеры, выполняющие одну программу: любой ценой достичь определённой точки. Они по сути не атакуют первыми, только реагируют на агрессию различными методами. Исключение - Ангел-рыбка. А для любого компьютера возможен режим удаленного управления. Маги же по сути так же являются результатом познания ангельских технологий, а потому возможно подходят для управления Ангелами

У меня начинает складываться ощущение, что если бы данный форум читал Хидеаки Анно, то он был потерял сон и снова впал в депрессию от подобных рассуждений и поисков скрытых смыслов в его творении

Я может где то упустил, но разве Чужая жизнь - это не фанфик на творение Хидеаки Анно? говорить о них как о двух разных вещах не имеет никакого смысла. та и честно говоря, неужели проще придумать какие то "убийственные", не поддающиеся осознанию теории, чем придумать реально интересные варианты развития событий?